提前发布 – 埃博拉疫情期间患者分诊的快速决策算法 – 第 30 卷，第 11 期 – 2024 年 11 月 – 新发传染病杂志
考虑到非特异性症状，仅根据临床理由怀疑埃博拉病毒病（EVD）对医护人员构成了挑战，特别是在早期阶段，这可能与其他急性感染有关。1）。因此，降低传播给医护人员、患者或看护人员的风险（2,3）要求对埃博拉病毒病怀疑使用广泛的案例定义（4–8）并使用系统的隔离和检测，即使只有一小部分可能的病例可能被感染。这种诊断方法需要分子诊断（逆转录PCR [RT-PCR]）对于大量样本。这种策略的缺点包括成本高和隔离病房过度拥挤（9,10），延迟考虑其他严重疾病（11），以及对应对措施的不满和不遵守（12），所有这些都可能导致社区传播。 根据患者获得埃博拉病毒病确诊的概率快速可靠地对其进行分类的能力可能会提高响应效率和接受度。这种分类可能会为标准隔离措施提供信息，并重新确定疑似病例 RT-PCR 检测的优先顺序，将重点转移到较小的高风险患者类别，减少卫生中心和埃博拉隔离单位的院内传播。13）。这种分类方法不仅可以加快诊断速度，最终改善埃博拉病毒病阳性患者的治疗和结果（14），还可以通过更快地识别病例患者和下游接触者来帮助控制疫情。通过这种分类方法识别早期埃博拉病毒病病例还可以在宣布疫情暴发之前在医疗机构中更快地发现疾病。 研究总体、数据集和变量 分诊算法的开发 预测变量的诊断性能是根据多元逻辑回归诊断从训练数据集中报告的（22），从而能够首先选择主要预测变量。预测因子与感染的关联可以是正相关，也可以是负相关，并且可能因就诊时间而异。我们在算法中纳入了 2 个组成部分：高度预测感染的变量的优先级规则，以及基于与感染具有强烈正向或负向关联的其他变量的 EVD 预测分数，同时还考虑了出现时间。对于第二个组成部分，我们根据 β 系数计算回归诊断的个体得分。我们使用变量选择过程来评估具有不同范围的个体分数的不同预测变量组的性能。我们在训练数据集的 30 个自举样本上评估了该算法的各个版本，并比较了分类性能（接收器操作特征下的面积） [AUROC] 曲线）。在性能足够的算法版本中，我们选择使用简单性作为选择最终版本的标准。 分类算法的外部验证 对于测试数据集中的每位患者，无论是否存在优先变量，我们都通过对存在的变量的各个分数求和来计算 EVD 预测分数。当评分预测因子的是/否值缺失时（20.2% 的患者缺失 >1 个评分变量），假设所述预测因子可能不存在，我们将个体评分为零（针对该变量）。我们从此次外部验证中排除了错过就诊时间的患者（589 名患者，4.1%）。 我们通过使用敏感性、特异性、阳性预测值 (PPV)、阴性预测值 (NPV)、阳性似然比 (LR+) 测试、阴性似然比 (LR–) 测试和 AUROC 来评估分类性能，以预测 EVD- RT-PCR 阳性诊断（参考标准）。由于测试数据集中 4 个优先变量中缺少数据，我们考虑了 3 类患者：如果存在 4 个优先变量中的任何一个（“是”），则优先（高风险）；如果这 4 个变量全部不存在，则不优先考虑（“否”）；当 4 个变量中没有一个为“是”但缺失 >1 时，未知。 前瞻性评估 一项前瞻性研究在现实生活条件下评估了这种分类工具。它是作为连续的子研究实施的，目标样本量为 65 名 EVD […]
提前发布 – 麻疹二次疫苗接种失败后的病毒继续传播 – 第 30 卷，第 9 期 – 2024 年 9 月 – 新发传染病杂志
作者所属：澳大利亚昆士兰州赫斯顿昆士兰大学（I. Trantner、N. Smoll、CL Lau、A. Dyda）；澳大利亚昆士兰州马鲁奇多尔阳光海岸医院和健康服务中心（N. Smoll、D.-L. Williams、D. Neucom、D. Barnekow） 麻疹病毒是最具传染性的病原体之一，基本繁殖数（R0）为12-18，这意味着每个感染者可以感染12-18个其他易感者（1)。2022 年，麻疹在全球造成约 136,000 人死亡，主要影响未接种疫苗的人和 5 岁以下未接种疫苗的儿童（1尽管死亡人数众多，但自 2000 年以来的 22 年间，麻疹疫苗接种已避免了约 5700 万人死亡（1）。由于麻疹仅存在人际传播，存在有效安全的减毒活疫苗，且没有健康携带者，因此麻疹本质上是一种可根除的疾病。到 2023 年，共有 82 个国家通过高免疫覆盖率实现了麻疹消除（2）。 尽管含麻疹病毒的疫苗有效，但接种疫苗的人仍有可能感染。这种现象被称为疫苗接种失败。已记录了两种类型的疫苗接种失败。原发性疫苗接种失败 (PVF) 是由于人未能对病毒抗原产生任何体液反应（非血清转化）造成的，据认为 5% 的疫苗接种者会发生这种情况（3)。继发性疫苗接种失败 (SVF) 似乎发生在最后一次疫苗接种后 6-26 年，是免疫力减弱或不完全的结果。2%–10% 的接种者会发生 SVF（4）。 SVF 后的麻疹感染，也称为改良麻疹，通常症状较轻（即咳嗽、鼻炎、结膜炎或发烧较少），病毒载量较低，且并发症风险较低（5）。这种形式的麻疹被认为是由于免疫反应不足但不缺失而发生的。换句话说，免疫力足以抑制症状和病毒复制，但不足以预防感染。在这种情况下，症状不明显使得根据典型特征识别麻疹病例变得不可靠。 在消除麻疹后，疫苗接种失败导致的麻疹病例占总病例的比例更高。这种情况发生在未接种疫苗的人感染麻疹的人数减少，剩下的易感人群是那些疫苗接种失败的人（6此外，在麻疹不常见的地区，接种疫苗的人不会接触野生病毒，因此不会获得天然的加强剂（7在地方性麻疹疫情中，接种疫苗者占麻疹病例的 3%–8%（4），相比之下，消除后环境中的病例比例为 14%–57%（4）。这种差距很可能是由于免疫力减弱和缺乏天然免疫增强剂而导致的 SVF 的结果，而不是原发性的疫苗接种失败，后者不会受到循环病毒流行的影响。 目前尚无普遍认可的麻疹 SVF 定义；但已提出了几种分类方法。最好的方法仍然是在接种疫苗后但感染前检测血清 IgG 和亲和力酶联免疫吸附试验。麻疹 IgG 在感染过程中较晚出现（通常在感染后 7-10 天），并持续很长时间（通常终生）（8）。 IgG亲和力指数可以确定近期（低亲和力IgG， 60%）接触麻疹病毒（9)。SVF 患者的特点是早期产生 […]
早期发布 – 牛乳腺中的禽流感和人流感 A 病毒受体 – 第 30 卷，第 9 期 – 2024 年 9 月 – 新发传染病杂志
作者单位：丹麦腓特烈斯贝哥本哈根大学（C. Kristensen、HE Jensen、LE Larsen）； Statens Serum Institut，哥本哈根，丹麦（R. Trebbien）；圣裘德儿童研究医院，美国田纳西州孟菲斯 (RJ Webby) 血凝素 (HA) 与末端附着在聚糖上的唾液酸 (SA) 结合，从而实现病毒的内吞和膜融合。适应人类和猪的 IAV 的血凝素通常倾向于以 α2,6 键与半乳糖 (Gal) 连接的 SA（SA-α2,6，人类受体），而禽类 IAV 则倾向于以 α2,3 键连接（SA-α2,3，禽类受体）（7此外，鸡感染的禽流感病毒通常偏好通过β1,4键与N-乙酰半乳糖胺连接的SA-α2,3-Gal（GalNac；SA-α2,3-Gal-β1,4-GalNac，称为鸡受体），而从鸭子中分离的禽流感病毒则偏好通过β1,3键与N-乙酰葡萄糖胺连接的SA-α2,3-Gal（GlcNac；SA-α2,3-Gal-β1,3-GlcNac，称为鸭受体）（7）。 为了研究上皮细胞表面的 IAV 受体表达，可以使用原位技术，例如凝集素组织化学（8)。使用凝集素的局限性在于它们仅提供有关宿主受体末端的信息；无法对受体进行完整的量化。三项研究报告了使用凝集素对牛呼吸道中的 IAV 受体进行研究（9–11)，但描述 IAV 受体在其他牛组织中的分布的研究很少。本研究的目的是通过凝集素组织化学研究牛乳腺中 IAV 受体的原位表达。 我们纳入了从同一只丹麦荷斯坦品种的哺乳奶牛（4 岁）身上获取的 2 个已存档的牛乳腺，以及从丹麦一家屠宰场获取的 8 头不同品种和年龄的奶牛的乳腺（表格）。这些组织经过福尔马林固定、石蜡包埋，并切成 4–5 µm 的切片。 图 1 图 1. 染色结果显示人类甲型流感病毒受体 (指定为 SNA) 在牛乳腺中广泛表达。A) SNA 染色示例… 图 […]
早期发布 – 2023 年中国儿童 SARS-CoV-2 和流感感染率及症状性比例 – 第 30 卷，第 9 期 – 2024 年 9 月 – 新发传染病杂志
作者所属：南京医科大学，中国南京（C. Shi、Y. Zhang、S. Ye、F. Zhu、B. Cong、S. Deng、Y. Li、B. Lu、X. Wang）；无锡市疾病预防控制中心，中国无锡（C. Shi、J. Zhou、Y. Gao、Y. Wang、B. Lu）；爱丁堡大学，英国苏格兰爱丁堡（Y. Li、X. Wang）。 SARS-CoV-2 和流感已造成重大健康威胁。截至 2023 年 5 月，SARS-CoV-2 已在全球造成超过 7 亿报告病例和 690 万人死亡，当时世界卫生组织 (WHO) 宣布 COVID-19 国际关注的突发公共卫生事件结束（1，2)。根据世卫组织全球流感监测和应对系统 (3季节性流感每年都会引发流行病，导致全球每年平均有 30 万至 60 万人死亡（4)。尽管在 COVID-19 大流行早期，季节性流感大幅下降，但在 2021 年 12 月及之后，流感再次出现复发；在 2022 年 12 月至 2023 年 5 月期间，流感活动分两波逐渐增加（3）。 在中国，2022 年 4 月至 […]
提前发布 – 低乙肝表面抗体患者改用卡博特韦/利匹韦林后乙肝病毒再激活 – 第 30 卷，第 8 期 – 2024 年 8 月 – 新发传染病杂志
美国疾病控制与预防中心 2013 年发布的指南指出，如果乙肝表面抗体 (anti-HBs) 滴度低于 10.0 mIU/mL 的临界值，一般不需要接种加强疫苗，但免疫功能低下者（1)。该建议基于这样的理解：接触乙肝病毒 (HBV) 通常会触发 B 淋巴细胞，最终在短时间内产生足够的抗体水平。然而，接触 HBV 后这种抗体反应的有效性取决于人的免疫状态。治疗慢性乙肝的主要目标是达到无法检测的乙肝表面抗原 (HBsAg) 水平。从 HBsAg 血清转换为抗 HBs 的病例被认为是功能性治愈，尽管从头再激活的风险仍然存在并且没有消除（2）。 单独的乙肝核心抗体 (抗-HBc) 阳性，定义为抗原阴性、抗-HBs 阴性和抗-HBc 阳性，被认为是隐匿性 HBV 感染的危险因素（3) 和 HBV 从头再激活（4)，表明存在两种不同的致病途径。第一种情况是治疗或自发缓解导致 HBsAg 转阴，而没有随后血清转换为抗 HBs。第二种情况是抗 HBs 水平在最初检测呈阳性后下降到检测阈值以下。当抗 HBs 水平下降时，预计暴露诱导的加强将产生预防作用。 我们描述了一名 HIV 患者的病例，在初步确认抗 HBs 阳性后，抗 HBs 滴度降至检测阈值以下。患者的药物从比克替拉韦/恩曲他滨/替诺福韦艾拉酚胺 (B/F/TAF) 改为卡博特韦/利匹韦林 (CAB/RPV)。他的 HBsAg 阳性复发，他又恢复为 HBV 携带者。 本研究已获得东京大学医学科学研究所伦理委员会的伦理批准（批准号：2022-48-1128）。患者同意根据《新发传染病》和国际医学期刊编辑委员会的政策发表本研究。 一名 52 岁的 […]
早期发布 – 阿根廷东北部米西奥内斯省的正汉坦病毒 – 第 30 卷，第 7 期 – 2024 年 7 月 – 新发传染病杂志
作者所属：阿根廷布宜诺斯艾利斯国家科学技术研究委员会 (CONICET)（MV Vadell、EF Burgos、D. Lamattina、L. Tauro、OD Salomón、IEG Villafañe）；阿根廷伊瓜苏港国家热带医学研究所 ANLIS Dr. CG Malbrán（MV Vadell、EF Burgos、D. Lamattina、OD Salomón）；布宜诺斯艾利斯国家传染病研究所 ANLIS Dr. CG Malbrán（C. Bellomo、V. Martínez、R. Coelho）；阿根廷米西奥内斯亚热带生物学研究所 (UNaM-CONICET)（C. Lanzone、CA Labaroni、L. Tauro）；布宜诺斯艾利斯生态、遗传学和进化研究所 (CONICET-UBA)、布宜诺斯艾利斯大学精确与自然科学学院 (IE Gómez Villafañe) 正汉坦病毒 是病毒科中全球分布的一属 RNA 病毒 汉坦病毒科在美洲，这些病毒的宿主是仓鼠科的本土啮齿动物（1虽然并非所有的正汉坦病毒都会导致人类患病，但有些基因型是汉坦病毒心肺综合征 (HCPS) 的病原体，这是一种严重的新兴疾病（1）阿根廷与巴西、智利并列为南美洲HCPS发病率最高的国家（1）。该国的 HCPS 病例分布在 4 个流行病学区域；东北部发病率最低。该地区的 HCPS 病例于 2003 年在米西奥内斯省南部首次出现（2）这些病例导致人们鉴定出 Lechiguanas 病毒和 Juquitiba 病毒，2 安得拉邦正汉坦病毒–like 基因型，作为病原体，以及 黑足小鼠 （黑足侏儒稻鼠）是 Juquitiba […]
提前发布 – 啮齿动物控制计划对伊朗人畜共患皮肤利什曼病发病率的影响 – 第 30 卷，第 7 期 – 2024 年 7 月 – 新发传染病杂志
阿米尔阿卜杜利 Samaneh Mazaherifar、Kavous Solhjoo、Mohsen Farhang Zargar、Hayedeh Parvin Jahromi、Ali Taghipour、Mohammad Darayesh、Milad Badri、Majid Pirestani、Shahab Falahi 和 Azra Kenarkoohi 作者隶属关系：伊朗贾赫罗姆医科大学（A. Abdoli、S. Mazaherifar、K. Solhjoo、M. Farhang Zargar、HP Jahromi、A. Taghipour、M. Darayesh）；伊朗加兹温医科大学（M. Badri）；伊朗德黑兰塔比亚特莫达雷斯大学（M. Pirestani）；伊朗伊拉姆医科大学（S. Falahi、A. Kenarkoohi） 利什曼病是一种被忽视的热带疾病，在世界范围内流行（1)。皮肤利什曼病 (CL) 在伊朗不同地区流行，发病率约为 1.18 例/100,000 人口，差异为 5.7 个伤残调整生命年 (2)。人畜共患皮肤利什曼病 (ZCL)，由寄生虫引起 大利什曼原虫是伊朗 CL 的主要病因，在伊朗，人传皮肤利什曼病是由 热带利什曼原虫不太普遍（2，3由于啮齿动物是 ZCL 的主要宿主，因此啮齿动物控制计划 (RCP) 是流行地区控制 ZCL 的重要干预措施（1）。ZCL 在伊朗法尔斯省贾赫罗姆县流行（附录图 1）。我们报告了 RCP 对该地区 ZCL 发病率的影响。本研究已获得伊朗贾赫罗姆医科大学研究与伦理委员会的批准（伦理代码 […]
提前发布 – 美国明尼苏达州 COVID-19 死亡判定方法，2020-2022 年 – 第 30 卷，第 7 期 – 2024 年 7 月 – 新发传染病杂志
截至 2023 年 11 月 1 日，美国已报告约 100 万例 COVID-19 死亡病例（1)，其中明尼苏达州居民超过 15,000 人（2)。文献表明，对于一般人群而言，与超额死亡率估计相比，COVID-19 死亡人数可能被低估（3–8）但可能过多地代表了非西班牙裔白人和老年人口（9）广泛的基于病例的死亡率调查需要耗费大量的时间和资源，这引发了一个问题：如何在 COVID-19 死亡率监测系统中平衡准确性、代表性和效率。 州和地区流行病学家委员会 (CSTE) 等国家组织为 COVID-19 相关死亡指定提供指导（14）；然而，死亡率监测方法主要由各个司法管辖区决定，可能有所不同。在 COVID-19 大流行初期，明尼苏达州建立了基于病例调查和死亡证明的死亡率定义，以便在发布第一个 CSTE 病例定义之前进行系统分类。 研究人群 我们的研究对象包括已确诊死于 COVID-19 的死者（根据明尼苏达州 COVID-19 死亡率的定义），以及被确定为不符合 COVID-19 死亡定义但死亡证明上包含 COVID-19 关键词的死亡（非 COVID-19 死亡）。我们排除了没有死亡证明的已确诊死于 COVID-19 的死者（例如，在州外死亡的明尼苏达州居民）。所有死者均为明尼苏达州居民，于 2020 年 3 月 19 日（明尼苏达州第一例 COVID-19 死亡病例）至 2022 年 12 月 31 日期间死亡。 COVID-19 死亡分类 […]
提前发布 – 中国养殖水貂中爆发自然严重发热伴血小板减少综合症病毒感染 – 第 30 卷，第 6 期 – 2024 年 6 月 – 新发传染病杂志
作者单位：中国农业科学院哈尔滨兽医研究所，中国哈尔滨（Y. Wang、M. Yang、H. Kang）； 山东第一医科大学和山东省医学科学院，中国泰安（H. Zhou、C. Quan） 严重发热伴血小板减少综合征（SFTS）是一种新发疾病，由一种新型蜱传布尼亚病毒 SFTS 病毒（SFTSV）引起，该病毒于 2009 年在中国首次发现。1）。 在中国之外，韩国、日本、越南、缅甸和巴基斯坦随后报道了 SFTS，目前已构成全球健康问题（2–6）。 SFTSV 是一种有包膜病毒，属于 班达病毒属家庭 苯病毒科命令 布尼亚病毒目。 该病毒有 3 个单链负义 RNA 片段，大（L）、中（M）和小（S）（1）。 这 长角血蜱 蜱被广泛认为是主要传播向量（7），但SFTSV的自然动物宿主仍不确定。 尽管在 SFTSV 流行地区的各种家畜（如山羊、牛、狗、猪、鸡和啮齿动物）中观察到高血清阳性率，但其中许多动物并未表现出明显的症状。 这些感染很可能是由受感染蜱虫传播 SFTSV 造成的（8）。 图1 图 1. 中国养殖水貂爆发自然发热伴血小板减少综合征病毒 (SFTSV) 感染的临床表现、TEM 分析和免疫荧光检测结果。 A–C) 临床表现是死亡 (A)，… 我们描述了中国山东省一家水貂养殖场爆发的 SFTS 疫情。 2022年5月下旬至7月初，该养殖场超过1,500只水貂出现呕吐、腹泻等症状，少数出现肢体抽搐。 大多数表现出临床表现的水貂死于该病（图 1，A 组）。 临床表现包括稀便、肠系膜淋巴结肿大和充血（图1，B和C图），与典型的肠炎症状一致。 多种抗生素治疗无效，通过胶体金免疫层析检测排除水貂肠炎病毒感染。 采集腹泻水貂（n = 10）的肠道组织样本，并送往中国农业科学院哈尔滨兽医研究所进行检测。 […]
提前发布 – 2022 年全球疫情中 Mpox 的潜伏期和系列间隔与历史估计相比 – 第 30 卷，第 6 期 — 2024 年 6 月 – 新发传染病杂志
作者单位：国立台湾大学，台北，台湾（L. Ponce、AR Akhmetzhanov）； 加州公共卫生部，美国加利福尼亚州里士满（NM Linton）； 约翰·霍普金斯大学，美国马里兰州巴尔的摩（WH Toh）； 台湾疾病预防控制中心，台北（H. Cheng）； 英国牛津大学（RN Thompson）； 麦克马斯特大学，加拿大安大略省汉密尔顿（J. Dushoff） Mpox 由猴痘病毒 (MPXV) 引起，是一种病毒性疾病，其特征为皮疹、流感样症状和发烧。 2022年，全球爆发的mpox疫情引起了公众越来越多的关注，并被认定为国际关注的公共卫生事件（PHEIC）。 与mpox感染相关的病死率（CFR）的历史估计因进化枝而异； 进化枝 I 的 CFR 为 »10%，而进化枝 II 的 CFR 1 次出现的术语“孵化”、“系列”、症状、发作或皮疹。 我们从 2022 年之前发表的研究中提取了感染的个案记录，并从 2022 年之后发表的研究中提取了潜伏期和序列间隔的估计值。经过重复数据删除后，搜索总共产生了 2,384 条参考文献（图 1）。 经过人工检查，我们认为2022年之前发表的与历史数据收集相关的参考文献共有101篇。 我们在 21 篇参考文献中找到了有关接触日期和症状发作的具体信息。 我们排除了 6 项包含重复数据的研究。 最终，我们选择了 15 个研究，总共 42 个病例记录。 其中，16 条记录与 I MPXV 相关，并且全部包含皮疹发病日期的信息； […]