猛犸象遗骸的 DNA 揭示了最后幸存种群的历史

放大 / 这是艺术家对弗兰格尔岛最后的猛犸象之一的构想。 贝丝·扎肯 大约 10,000 年前,海平面上升导致弗兰格尔岛与西伯利亚大陆分离,一小群猛犸象被困在岛上。小群孤立的动物种群导致近亲繁殖和基因缺陷,长期以来人们一直认为弗兰格尔岛的猛犸象最终在大约 4,000 年前死于这个问题。 然而,周四发表在《细胞》杂志上的一篇论文对大陆和弗兰格尔岛孤立猛犸象 5 万年的基因组进行了比较,发现情况并非如此。这篇论文的作者发现,这不仅挑战了我们对这一孤立猛犸象群和小种群进化的理解,而且对当今的保护工作也具有重要意义。 严重的瓶颈 这是这篇新论文背后国际团队成员多年基因测序的成果。他们研究了 21 个猛犸象基因组——其中 13 个是主要作者 Marianne Dehasque 新近测序的;其他基因组几年前由合著者 Patrícia Pečnerová、Foteini Kanellidou 和 Héloïse Muller 测序。这些基因组来自西伯利亚猛犸象(原来的猛犸象),既来自大陆,也来自岛屿在孤立之前和之后。最古老的基因组来自一头雌性西伯利亚猛犸象,它死于约 52,300 年前。最年轻的基因组来自弗兰格尔岛雄性猛犸象,它们在最后一头猛犸象灭绝时就已灭绝(其中一头死于 4,333 年前)。 放大 / 西伯利亚北部的弗兰格尔岛有广阔的苔原。 爱达伦 这是一个引人注目且具有启发性的时间跨度:样本中的猛犸象种群最初体型庞大、基因健康,后来经历了隔离,最终灭绝。 研究小组在论文中指出,猛犸象经历了一段“气候动荡时期”,特别是在被称为 伯林-阿勒罗德国际机场 (约 14,700 至 12,900 年前)——其他人认为这段时间可能导致当地猛犸象灭绝。然而,对这一时期猛犸象基因组的研究并未表明气候变暖有任何不利影响。 只有当岛上居民被隔离后,不利影响才会显现,而且影响十分剧烈。 研究小组的模拟结果表明,在最小数量时,弗兰格尔岛猛犸象的总种群数量不足 10 只。这代表着严重的种群瓶颈。从遗传学角度来看,这可以通过基因组中纯合性运行的增加来体现,这是由于父母双方贡献的染色体几乎相同,均来自最近的祖先。弗兰格尔岛孤立猛犸象的纯合性运行是海平面上升前的四倍。 尽管猛犸象数量少得可怜,但它们还是恢复了。在接下来的 6000 年里,猛犸象的种群规模、近亲繁殖水平和遗传多样性一直保持稳定,直到它们灭绝。与最初的种群瓶颈不同,随着时间的推移,基因组特征似乎表明近亲繁殖最终转向了更远亲的配对,这表明猛犸象种群规模更大或行为发生了变化。 他们的模拟表明,在 20 代内,猛犸象的种群规模将增加到约 200-300 […]