艾氯胺酮联合右美托咪啶对 ICU 机械通气患者镇静期间谵妄的影响：随机对照试验嵌套子研究方案 | 试验
Wilson JE、Mart MF、Cunningham C、Shehabi Y、Girard TD、MacLullich AMJ 等人。《谵妄》。《自然评论疾病引物》。2020；6(1):90。 https://doi.org/10.1038/s41572-020-00223-4。 文章 PubMed PubMed Central 谷歌学术 Jayaswal AK, Sampath H, Soohinda G, Dutta S. 重症监护病房中的谵妄：发病率、亚型、风险因素和结果。《印度精神病学杂志》。2019；61(4)：352–8。 https://doi.org/10.4103/psychiatry.IndianJPsychiatry_583_18。 文章 PubMed PubMed Central 谷歌学术 Pandharipande P、Cotton BA、Shintani A、Thompson J、Pun BT、Morris JA Jr 等。外科和创伤重症监护病房患者谵妄症的患病率及风险因素。《创伤杂志》。2008；65(1)：34-41。 https://doi.org/10.1097/TA.0b013e31814b2c4d。 文章 PubMed PubMed Central 谷歌学术 Chaiwat O, Chanidnuan M, Pancharoen W, Vijitmala K, Danpornprasert P, Toadithep […]
一种利用高维组学数据预测癌症生存的新型非负贝叶斯叠加建模方法 BMC 医学研究方法论
我们将所提出的方法应用于三个具有生存记录和大规模基因表达谱的真实癌症数据集。 对于这些数据集，使用 BhGLM 包中的协变量函数对基因表达数据进行标准化。 我们将原始数据随机划分为样本量相等的两个子集：一个用于训练模型，另一个用于评估模型性能。 该过程重复了 100 次，以防因数据分裂而出现意外结果。 为了确保平衡的响应，我们对训练数据和测试数据之间的生存曲线进行了对数秩检验，并考虑那些 Plog-rank > 0.5 的平衡分割，将保留以供进一步分析。 使用基因组注释工具将基因映射到通路。 更准确地说，我们首先使用 annotateI 包将基因符号映射到 Entrez Ids，然后使用 clusterProfiler 包将基因映射到 KEGG 路径（默认参数） [31]。 TCGA 乳腺癌数据集 我们从“GDC数据门户”获取了TCGA乳腺癌（BRCA）的转录组图谱（TPM格式）和相应的最新生存信息（https://portal.gdc.cancer.gov/）。 我们选择了具有生存结果和基因表达谱的女性样本。 零表达量 > 50% 的基因被滤除，分位数方差 > 20% 的基因被保留。 最终，我们得到了一个由 1060 个样本和 13,745 个基因组成的数据集。 这些基因被映射到涉及 3855 个基因的 140 个通路（见补充表 3）。 在叠加过程之前，我们进行了初步的通路筛选，以识别那些具有潜在预测价值的通路。 我们分别对原始数据中的所有 140 个路径安装了 Lasso Cox，并获得了每个路径的 C 指数。 共有 […]