祖先差异影响 CRISPR-Cas9 引导在人类细胞中的表现

免费注册收听本文 谢谢。使用上面的播放器收听这篇文章。✖ CRISPR/Cas9 基因编辑使大量生物医学实验成为可能,包括系统性地关闭癌细胞中的基因以寻找癌细胞生存和生长所依赖的基因的研究。这些基因或“癌症依赖性”通常是有希望的药物靶点。但新的研究表明,许多 CRISPR 筛选实验依赖于称为 CRISPR/Cas9 向导的成分,这些成分在所有血统的人的细胞中表现并不相同,这可能导致 CRISPR 筛选错过癌症依赖性。 这些 CRISPR 向导是短 RNA 序列,可引导 CRISPR Cas9 酶到达基因组中的特定位点,以切割 DNA 并停用目标基因。麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的科学家的新发现表明,这些向导中约有 2% 会错过目标。这意味着 Cas9 不会切割并禁用特定基因,从而掩盖该基因在癌症生长中的潜在作用。研究小组发现,这种情况在非洲血统的人的细胞中发生的比例过高,因为 CRISPR 向导是使用主要来自欧洲血统的人的参考基因组设计的,并不完全代表全球遗传多样性。 “这些不准确之处可能存在于我们无法识别的地方,而且以我们无法预测的方式存在,” 拉米恩·贝鲁金布罗德研究所的准会员,也是该论文的共同资深作者,该论文最近发表在 自然通讯“这项研究表明,对我们使用的所有工具和数据集进行系统评估是非常值得的,这样我们就可以在这些隐藏的偏见成为问题之前解决它们。” “CRISPR 在临床前研究中被广泛使用,但只有少数研究人员仔细考虑与他们的模型系统相关的特定种系和祖先,”他补充道 杰西·博姆布罗德研究所的一位助理科学家和本文的共同资深作者。“这是对社区的一次警告,功能基因组学并不能免受祖先偏见的影响,也是更仔细地研究此类数据的机会。” 在他们的研究中,研究小组分析了布罗德研究所的 癌症依赖性地图 (DepMap)是最大的癌症依赖资源,目前包括对 1,000 多种癌细胞系的全基因组筛查,其中约 90% 来自欧洲或东亚血统的人。 弗朗西斯卡·巴斯克斯布罗德研究所 DepMap 主任表示,DepMap 中不到 1% 的细胞系-指导对受到本研究显示的祖先偏差的影响,但这些偏差对于在未来的文库中识别和修复非常重要。这些结果首次作为 预印本 2022 年,DepMap 团队从他们的库中删除了所有不起作用的向导 RNA,因此数据库不会错误地返回受影响基因没有依赖关系,而是表明没有足够的数据来得出结论。 一种新型的依赖性搜索 此前,对癌症依赖性的研究主要集中在人一生中某些细胞中发生的基因变化,即体细胞突变。但当博士后研究员、研究第一作者 Sean Misek 于 […]

理光与 ERS ​​Genomics 签订 CRISPR/Cas9 许可协议

CRISPR/Cas9基因组编辑技术有助于扩大新型疾病模型的创建 东京和都柏林–(美国商业资讯)–理光株式会社今天宣布与 ERS ​​Genomics Limited(“ERS Genomics”)在美国和日本签署非独家许可协议,以获取基础 CRISPR/Cas9 基因组编辑技术专利由 ERS ​​Genomics 管理。 CRISPR/Cas9 是一项突破性的基因编辑技术,可以轻松修改目标基因组序列。 该技术是药物发现研究的重要工具,并在各个领域都有应用。 2022年,理光完成了对Elixirgen Scientific, Inc.(美国马里兰州巴尔的摩)的收购。 Elixirgen Scientific拥有人类iPS细胞*2快速高效分化*1以及mRNA*3设计、生产和管理的核心技术。 我们的目标是通过将这些核心技术与CRISPR/Cas9基因组编辑技术相结合,预测候选药物针对不同遗传背景患者的作用机制,并提高mRNA设计的速度和效率。 通过对细胞进行基因编辑等操作来增强或减弱特定功能,可以创建高度可靠的疾病模型,包括罕见疾病的模型。 这一进步预计将缩短药物开发时间并提高成功率。 理光利用我们在数字和人工智能技术方面积累的专业知识,一直在扩大 Elixirgen Scientific 技术的应用领域。 该举措旨在加速个性化医疗*4、药物发现研究和再生医学。 理光继续通过 Elixirgen Scientific 提供的多样化解决方案为加速药物开发研究做出贡献。 Summit Pharmaceuticals International Corporation(日本东京千代田区)是住友商事株式会社(日本东京千代田区)的子公司,是 ERS ​​Genomics 在日本的独家代表。 *1 分化:细胞变得特化以执行特定功能的过程,如肝细胞、血细胞或神经元。 *2 诱导多能干细胞(iPS):iPS细胞是人工创造的多能干细胞,具有分化成各种细胞类型的能力。 *3 mRNA(信使核糖核酸):mRNA是携带DNA遗传信息的RNA,充当蛋白质合成的指令。 *4 个体化医疗:根据个人的健康状况、遗传信息和其他个人特征提供最佳治疗。 查看源版本 美国商业资讯网: https://www.businesswire.com/news/home/20240313874100/en/ 本·鲁特博士 酶通信公司 电话:+44(0)7920 770 935 电子邮件: […]

Crispr-Cas9 基因剪刀治愈了第二种罕见且可能致命的疾病

解密- 一次注射似乎足以使十名患有遗传性血管性水肿的患者得到缓解。 一种新的罕见但可能致命的遗传病,遗传性血管性水肿,可以通过以下方法治愈 基因治疗。 至于 2021 年转甲状腺素蛋白淀粉样变性,使用 Crispr-Cas9 基因剪刀技术的单次注射治疗似乎足以使患者病情缓解,使他们免于终身治疗。 这是一项针对 10 名患者进行的试点研究,并发表在期刊上 新英格兰医学杂志 谁刚刚透露了这一点。 遗传性血管性水肿表现为某些组织突然、随机、有时出现疼痛性肿胀,特别是皮肤和消化道。 癫痫发作,通常开始于 从小,是短暂的,但如果影响上呼吸道,可能会导致窒息死亡。 在法国,有 1,500 人受到这种疾病的影响,其中 800 人已经接受国家血管性水肿参考中心 (Créak) 的监测。 « 本文仅供订阅者使用。 还有 77% 的内容有待您去发现。 闪购 €4.49/月,为期 12 个月 已经订阅? 登录 1709522581 #CrisprCas9 #基因剪刀治愈了第二种罕见且可能致命的疾病 2024-03-03 15:32:15

基于纳米技术的 CRISPR/Cas9 递送系统,用于癌症治疗中的基因组编辑

该综述由宫长阳教授设计,其博士生周诗尧撰写。 首先,他们阐述了CRISPR/Cas9系统的机制。 CRISPR/Cas9系统由Cas9蛋白和单链定向RNA(sgRNA)组成。 在存在原型间隔子相邻基序 (PAM) 的情况下,sgRNA 准确地将 Cas9 核酸内切酶引导至目标区域,在该区域引起 DNA 双链断裂 (DSB),从而导致位点特异性基因组变化。 DSB 创建后可通过两种主要基因组编辑途径进行内源 DNA 修复:非同源末端连接 (NHEJ) 或同源定向修复 (HDR)。 利用Cas9在sgRNA指导下靶向特定DNA序列的生物学特性,科学家们进一步开发了基于dCas9的基因打靶激活和基因打靶抑制工具,分别称为CRISPRa和CRISPRi。 接下来,概述了三种形式的 CRISPR/Cas9 货物的特征。 CRISPR/Cas9系统的三种递送形式是质粒、mRNA/sgRNA和核糖核蛋白(RNP)复合物,每种形式都有自己的优点和缺点。 然而,无论有效负载形式如何,CRISPR/Cas9 穿透靶细胞都具有挑战性。 因此,开发有效的 CRISPR/Cas9 递送纳米技术策略至关重要。 然后,对这三类基于纳米技术的癌症治疗递送技术进行了全面总结。 尽管病毒载体是CRISPR/Cas9系统最常用的递送载体,但由于包装容量有限、免疫原性高和缺乏组织靶向等缺点,其应用受到限制。 纳米载体,包括阳离子脂质纳米颗粒、阳离子聚合物/多肽纳米颗粒、无机纳米材料、DNA纳米结构、金基纳米颗粒和外泌体或细胞外囊泡,是目前有望用于CRISPR/Cas9系统的递送方法。 以基于阳离子脂质的非病毒载体为例,阳离子脂质载体可以通过静电相互作用加载CRISPR/Cas9系统。 此外,可以通过配体修饰或结构修饰来增强载体的靶向性,以促进细胞摄取并提高递送效率。 在特定的细胞内环境或细胞外信号触发下,响应性纳米载体还可以实现CRISPR/Cas9的特异性释放,实现时空可控的基因编辑。 这些基于纳米技术的智能递送系统显着提高了CRISPR/Cas9系统的肿瘤治疗能力,并显着减少了其脱靶效应。 最后,他们还就基于纳米技术的 CRISPR/Cas9 系统交付的未来研究方向提供了新颖的见解。 使用 CRISPR/Cas9 纳米技术进行基因编辑是癌症治疗领域的新曙光。 CRISPR/Cas9递送非病毒载体的不断优化和改进显示了其在肿瘤治疗领域的巨大研究和应用潜力。 尽管如此,大部分研究仍处于早期阶段。 此外,CRISPR/Cas9在分子水平上还有许多未解决的问题。 综上所述,基于CRISPR/Cas9的个性化靶向治疗可能是肿瘤治疗的未来,为肿瘤治疗带来新的希望。 Xu X, Liu C, Wang Y, Koivisto O, Zhou […]