蛋白质组学方法 decryptE 测量药物诱导的细胞表型

大多数药物都会影响、产生或消除蛋白质。许多药物本身就是蛋白质。为此，蛋白质组学正在为药物发现做出重要贡献，无论是分解靶点还是阐明作用机制。现在，一种新方法 decryptE 采用蛋白质组范围的方法来测量药物诱导的蛋白质表达变化的剂量反应特征。

本作品发表于 自然生物技术 在论文中，“通过剂量分辨表达蛋白质组学解密细胞药物表型的分子基础”

“许多药物的作用比我们想象的还要大，”慕尼黑工业大学生命科学学院蛋白质组学和生物分析学教授 Bernhard Küster 博士说道。“一个常见的例子就是阿司匹林。它作为止痛药的有效性已得到充分证实。但观察表明，其有效成分乙酰水杨酸 (ASA) 也具有血液稀释作用。如今，它通常用于治疗中风或心脏病发作的患者。我们相信，许多广泛使用的药物也具有我们尚未意识到的作用。我们研究的目标之一就是系统地寻找它们，而不必等待这样的偶然发现。”

研究人员在 18 小时内用不同剂量的 144 种活性物质处理细胞。大多数药物目前用于癌症治疗或处于临床审批阶段。提取蛋白质后，使用质谱法进行分析，以便进一步研究细胞反应。

癌症是揭示细胞表型详细理解为何如此重要的一个典型例子：不同的癌症在分子水平上发生的过程非常不同。对该团队的数据进行分析，为已知的表型药物效应提供了分子解释，并揭示了人类药物作用机制的新方面。借助这些数据，该团队能够证明，例如，免疫系统可能会被 HDAC 抑制剂削弱。更具体地说，他们表明“组蛋白去乙酰化酶抑制剂强效且强烈地下调了 T 细胞受体复合物，导致体外和离体人类 T 细胞活化受损。”这一发现可能会影响利用免疫系统的肿瘤治疗。作者写道，它还可以“合理解释组蛋白去乙酰化酶抑制剂在某些淋巴瘤和自身免疫性疾病中的疗效，并解释它们在治疗实体瘤方面表现不佳的原因。”