早期发布 – 野生鸟类中的新型禽流感 A(H5N6)，韩国，2023 年 – 第 30 卷，第 6 期 — 2024 年 6 月 – 新发传染病杂志

高致病性禽流感病毒（HPAIV）引起的感染给养禽业造成重大经济损失，对公众健康构成严重威胁。 H5 HPAIV 的 A/Goose/G​​uangdong/1/1996 (gs/GD) 谱系于 1996 年在中国出现，并分化为 10 个遗传独立的血凝素 (HA) 分支 (0-9) 和亚分支 (1）。 H5 HPAIV 的 gs/GD 谱系已在世界范围内引发疫情，感染一系列野生动物、家禽和人类（1）。 进化枝 2.3.4.4 H5Nx HPAIV 含有多种神经氨酸酶 (NA) 亚型（2）从 2014 年起在全球范围内主导疫情，并进一步分为分支 2.3.4.4a–h（3）。 目前，2.3.4.4b 分支 H5N1 HPAIV 在 2020 年秋季在欧洲以及非洲、美洲、亚洲和南极洲爆发疫情后在全球占据主导地位（4–7）。

2022年10月至2023年3月期间，共有16种不同基因型的H5N1 2.3.4.4b HPAIV在韩国引起疫情，其中野鸟病例174例（8）。 根据现有监测数据，2023 年夏季和秋季韩国没有发生新的病毒入侵。韩国于 2023 年秋季开始对 HPAIV 进行国家监测。我们从 2023 年夏季和秋季在韩国发现的野生鸟类尸体中分离出 3 株 H5N6 HPAIV。 2023 年 12 月（A/大天鹅/韩国/23WC075/2023[H5N6]A/大天鹅/韩国/23WC116/2023[H5N6]和A/豆鹅/韩国/23WC111/2023[H5N6]）（附录表1）。 我们对分离株进行了下一代测序，并公开分享了完整的基因组序列。 我们进行了比较系统发育分析，以推断病毒的起源和进化。

H5N6 病毒和 A/peregrine falcon/Saga/4112A002/2023(H5N6) 的每个基因的最近共同祖先 (tMRCA) 的估计时间范围为 2023 年 2 月至 11 月（图；附录表 2）。 根据 tMRCA 95% 最高后密度区间重叠的基础上，我们假设新型重配 H5N6 病毒于 2023 年 8 月至 10 月左右出现，并被引入日本和韩国。 NA基因的最大进化枝可信度树显示，来自日本和韩国的野鸟H5N6病毒与来自中国的H5N6病毒人类感染病例（A/Changsha/1/2022）具有共同的祖先。 自2014年以来，中国共报告了90例人感染H5N6病例；大多数感染病例是在2021年之后报告的（9; https://iris.who.int/handle/10665/375483）。 日本、韩国野禽H5N6病毒和中国人感染H5N6病毒的tMRCA估计为2022年6月12日（95%最高后验密度2021年12月7日-2022年11月10日）（图；附录表2 ）。 2022年底，在中国传播的祖先H5N6 HPAIV可能将NA基因捐赠给2.3.4.4b H5N1病毒。当前和祖先H5N6 HPAIV的N6基因具有可能在家禽中传播病毒期间获得的茎部缺失（10）。

H5N6病毒在HA中具有分子标记T188、V210、Q222和G224，这些标记与α-2,3唾液酸受体的结合亲和力相关。 我们观察到 HA 中的 S133A 和 T156A 突变，已知与 α-2,6 唾液酸受体的结合增加有关。 我们在聚合酶基本 2 中观察到了 L89V，但没有在 Q591K、E627K 和 D701N 中观察到。 我们还观察到聚合酶碱性 1 中的 D622G、毒蕈碱 1 中的 N30D 和 I43M 以及非结构蛋白 1 中的 P42S，它们与小鼠毒力增加相关。10）。

之前的报告表明，进化枝 2.3.4.4b 的基因组正在通过频繁的基因组重配而进化，形成短暂且多样化的基因组星座变化，没有明显的基因片段关联模式（8）。 在 2023-24 年冬季期间，从韩国和日本的野生鸟类中检测到 H5N6 HPAIV，我们的系统发育分析表明，H5N6 HPAIV 最有可能源自 2022-2023 年期间传播的 2.3.4.4b H5N1 病毒分支，是通过与其他低病毒的重配进化而来的。致病性禽流感病毒和高致病性禽流感病毒，在秋季迁徙季节由野生鸟类引入韩国和日本。 需要加强对野生鸟类 HPAIV 的基因组监测，以便及早发现和监测病毒的进一步进化和传播。

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