Pixelgen Technologies 宣布在《自然方法》中发表关于分子像素化技术的同行评审出版物

研究人员展示了第一个基于测序的、无光学的单细胞空间蛋白质组学方法

这项名为“分子像素化：通过测序对单细胞进行空间蛋白质组学”的研究阐释了基于 DNA 条形码的策略识别和可视化免疫细胞受体空间蛋白质组织的 3D 能力。 免疫细胞表面受体如何相对彼此组织，以及它们的行为控制细胞的许多重要功能。 研究人员传统上通过显微镜、在固定样品上使用荧光团标记的抗体或通过流式细胞术来研究空间表面蛋白质组织。 这些方法在多路复用和样本吞吐量方面存在局限性，并且数据只能以二维方式可视化。

MPX 使用 DNA 标记抗体（抗体寡核苷酸缀合物，AOC）与化学固定细胞上的蛋白质靶标结合，以高度多重方式调查细胞表面蛋白质排列。 不需要样品固定或单细胞区室化，测定在标准反应管中进行。 DNA 像素是独特的纳米尺寸 DNA 球体，用于在相邻 AOC 之间形成关联，从而可以对蛋白质排列进行空间分析。 然后对生成的扩增子进行测序，并通过计算将读数排列到每个单细胞的空间蛋白质组网络中。

该研究处理了针对 T 细胞、NK 细胞、B 细胞、树突状细胞和单核细胞的异质 80 重蛋白质组。 它证明了 MPX 能够生成有关外周血单核细胞 (PBMC) 蛋白质丰度的单细胞数据。 它还确定了趋化因子刺激的 T 细胞中已知和新颖的蛋白质空间组织模式。 结果表明 MPX 能够根据表面蛋白的空间排列来定义细胞状态。

“这项研究强调了单细胞空间蛋白质组学的重要性，它可以为细胞运动和激活、药物作用模式以及基于空间聚类和细胞间通讯的药物靶标发现带来新的见解，”说Filip Karlsson，Pixelgen 首席技术官，也是该论文的主要作者。 “我们相信 MPX 比传统技术具有显着优势，并将在指导旨在空间重组细胞表面蛋白以支持免疫调节活动的疗法开发方面发挥重要作用，包括预调节癌症 CAR-T 细胞中的免疫突触，并更广泛地为新一代药物和诊断学铺平道路。”

“如本研究所示，能够分析单个白细胞中蛋白质的空间分布和共定位，对于我们研究细胞如何通过细胞间相互作用进行调节并根据环境因素调整其功能具有巨大价值，”补充道Petter Brodin，医学博士、博士，卡罗林斯卡学院和伦敦帝国理工学院儿科免疫学教授，也是该论文的合著者。 “这个额外的空间维度为我们习惯于研究的蛋白质和 mRNA 丰度测量提供了一个正交的信息层，我们渴望了解它将来会告诉我们什么。”

关于 Pixelgen 技术公司
Pixelgen Technologies AB 由一群充满热情、经验丰富的创新者和企业家于 2020 年创立，其愿景是通过绘制细胞表面蛋白及其空间相互关系，为生物学带来新的空间理解。 该公司开发了分子像素化，这是一种基于 DNA 的可视化技术，用于分析细胞表面蛋白质，以获得对细胞活动的新见解，从而推动更好的药物和诊断。 Pixelgen 总部位于瑞典斯德哥尔摩。

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消息来源 Pixelgen Technologies