高危孕妇产科病房粘质沙雷氏菌血流感染疫情调查 BMC 传染病

设计

本报告为回顾性单中心研究。 我们报告了在感染爆发控制期间使用 ATP 检测的经验。 此外,通过全基因组测序分析了患者的保守分离株,以确认患者的感染是相关的。

参加者

病例定义为2021年8月22日至10月13日期间在高危孕妇病房诊断为粘质沙门氏菌BSI的患者。年龄范围为27-38岁,住院时间为17-29岁天。 (桌子 1)。 指示患者预计于 2021 年 8 月 22 日发病(图 1)。 1)。 疫情调查期间又发生一例。 此次疫情中总共发现了 4 例 BSI 病例。 如果没有患者或医护人员的移动,则排除同期在其他病房发生的粘质沙门氏菌 BSI。

表1 粘质沙门氏菌血流感染患者的临床结果 1

患者住院时间及粘质沙雷氏菌血流感染时间。 箭头代表血培养测试的每个日期。 ATP,三磷酸腺苷

这4名患者于2021年8月12日至10月18日期间住院。他们在住院后至少5天(5至21天范围内)出现发烧,发烧2小时内采集的血培养证实粘质沙门氏菌发病。 (桌子 1)期间,同一病房共有47名患者住院。 病区的两个病区中,只有一个病区出现疫情。 疫情地区共有26名患者住院治疗(图1)。 2)。

图2

病房平面图及感染病人出现顺序。 疫情爆发按顺序发生,从最初的患者 A(指示病例)开始,逐渐发展到后续患者(B、C、D)。 箭头:感染传播的顺序和路径

环境

釜山大学梁山医院拥有 1,205 张床位,是一家教学三级医院,年收治病人数为 42,000 人次,年住院日数为 309,000 人次。 感染控制科2021年配备9名护士和2名传染病医生。产科病房有7张床位,用于照顾有妊娠高血压、子宫早缩、早破等早产风险的孕妇。胎膜脱落和早产。

病房分为两部分,分别由三张床位和四张床位组成(图1)。 2)。 疫情仅限于一个地区。 病房平均每月有 18 名患者住院(每年病房住院 1,942 个患者日)。 一名医生从上午 9:00 到下午 6:00 值班,并由一名教职人员监督。 非工作时间有值班医生。 护士实行三班倒,每班分配一名护士。

高危孕妇产科病房的患者人群与我院其他普通成人病房的患者人群有所不同。 首先,人群仅限于孕妇。 其次,没有患者在患妊娠相关疾病之前接受过长期医疗保健治疗。 第三,中心静脉导管和留置导管的频率很低,病房内不使用呼吸机。 2018年至2022年6月,该病区住院患者中BSI的月平均发病率为0.77%。 相比之下,仅粘质沙门氏菌爆发期间的 BSI 率为 8.51%。 在此期间,没有报告多重耐药鲍曼不动杆菌或铜绿假单胞菌以及耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌感染。 (补充材料 1)。

该病房住院的孕妇根据病情接受静脉注射和必要的检查。 大多数注射是通过外周静脉进行的。 阿托西班、硫酸镁或利托君是病房最常用的注射剂。 在常规实践中,每天进行两次无压力测试(NST),每 1-2 周进行一次超声检查。 如果患者的宫颈长度较短,则大约每周进行两次经阴道超声检查。

疫情识别

2021年10月5日,研究中心感染预防科接到产科病房连续发生3例粘质沙门氏菌血流感染(BSI)病例报告。 2015年以来,医院内未发生粘质沙门氏菌疫情报告。 产科病房内没有确认其他细菌引起的疫情。

在认识到疫情爆发后,临床微生物学部门要求保存患者身上可用的粘质沙门氏菌分离物以进行全基因组测序。 此外,与病房医务人员协商后计划进行现场调查。

干预措施

环境及人员调查

2021年10月7日,感染预防科护士到病房进行现场检查及ATP生物发光检测(3M™ Clean-Trace™ Surface ATP; 3 M, St. Paul, MN, USA) [11]。 测试重点关注高接触区域(表 2)。 我们认为重复清洁的阈值是 250 相对光单位 (RLU)/100 cm2 的 ATP 生物发光水平,并进一步将 ≥ 1000 RLU 定义为“不清洁”。 [11, 12]。

表 2 用于疫情调查的 ATP 生物发光测量

2021年10月7日至12日对医护人员进行了手部卫生监测。六天后,即2021年10月13日,进行了环境培养测试。 将环境表面样品在胃匀化器中均质化,并将洗脱液在含有 5% 羊血的胰蛋白酶大豆琼脂平板和 MacConkey II 平板上培养。 使用插入塑料管的无菌拭子进行取样。 对患者和医护人员区域的产品或表面进行环境培养(表 3)。 此外,还从工作人员(三名护士和两名医生)的手中获取了培养样本。

表3 环境文化中测试的产品和表面通过现场监测和自我报告对工作人员进行教育和反馈

2021年10月14日至2021年11月14日,感染控制护士每天在周一至周五的规定时间进行一次手卫生监测和现场教育。

检查产科病房工作人员是否遵守以下事项并现场反馈:手卫生七步骤五点 [13]安全注射实践 [14]经阴道超声检查探头的清洁指南 [15]环境清洁管理指南 [16]。 病房也更换了人员配置。 由每班一名护士改为两名护士。 此外,在疫情控制会议上,病房工作人员还被询问了对遵守病房标准预防措施的障碍的意见。 现场培训期结束后,2021年11月15日至11月19日再次进行手卫生监测。

培养和打字

抗生素敏感性测试

使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS;bioMerieux,Nurtingen,德国)对分离株进行物种水平鉴定,并使用 VITEK-2(bioMerieux,Durhum,NC)进行抗生素敏感性测试, 美国)。 使用临床和实验室标准研究所指南,根据粘质链球菌的鉴定标准对结果进行解释 [17]。

全基因组测序

当发现疫情爆发时,指示病例的分离株被丢弃。 因此,对三名患者的分离株进行了全基因组测序。 使用 Illumina MiSeq(Illumina, Inc., San Diego, CA, USA)对粘质链球菌分离株的基因组进行了完整测序。 对这组基因组进行系统发育树推断,包括本研究中获得的样本基因组、沙雷氏菌模式菌株(n = 18)以及全基因组 Mash 距离 < 0.1 的去复制基因组的代表性基因组。或更多样本基因组。 沙雷氏菌的核心基因是从沙雷氏菌的可用基因组中预定义的。 使用 CoreCruncher 在 CJ Bioscience 细菌基因组数据库中 [18]。 首先使用由 868 个核心基因构建的内部 Serratiacore 基因组多位点序列分型 (cgMLST) 方案筛选样品和参考基因组内或之间密切相关的菌株对的存在 [19]。 我们分析了核心基因组单核苷酸多态性 (cgSNP),以提供基因组之间更可靠的克隆水平相关性。 使用 split kmer 分析版本 1.0 对样本的核心基因组和参考基因组中的 SNP 进行计数 [20]。 我们包含了一组菌株的成对 cgSNP 距离,其中包括样本菌株和任何与任何样本菌株显示 <({1times {text{e}}}^{-4})SNP 距离的菌株。 如果三个已识别的分离株不同地属于多个簇,或者如果与可能发生传播的时间尺度相比,SNP 差异过于显着,则将其视为单独获得的而不是患者之间的传播。 为了筛查病原体引起的潜在传播,我们定义了核心 SNP 差异≤ 7 至 10 个的分离株对 [21]。

感染相关的结果

患者 C 在出现粘质沙门氏菌 BSI 后第二天接受了紧急剖腹产手术。 没有患者死于粘质沙门氏菌菌血症,患者所生的新生儿也没有出现粘质沙门氏菌感染的证据(表 1)。 患者A被转移到另一家医院; 因此,无法确定她的产科结果。

对内部有效性的潜在威胁

与疫情爆发前一年同期相比,抗生素政策没有变化。 截至2021年6月,病区手卫生执行率维持在85%-90%左右。疫情发生前手卫生无明显变化。

2024-02-28 07:44:22
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