SickKids 的科学家为早期发现心肌病奠定了基础

在第一项使用全基因组测序来检查心脏病中串联重复扩增的研究中，病童医院 (SickKids) 的科学家为心肌病的早期检测和未来的精准治疗奠定了基础。

心肌病是一种遗传性心脏病，每 500 人中就有一人患有心肌病。 这种情况会影响心脏的结构和功能，并最终导致心力衰竭。

SickKids 领导的研究发表于 电子生物医学部分 柳叶刀发现科学，表明串联重复（一种遗传变异形式）在心肌病患者中更常见，并且可能导致 4% 的病例。 已知串联重复扩增 (TRE) 会导致 60 多种病症，并且通常具有遗传成分。

“以前 TRE 参与心肌病的程度尚不清楚，”该研究的共同负责人、遗传学和基因组生物学项目的高级科学家 Ryan Yuen 博士说。 “我们现在知道了另一种方法来识别那些患这种疾病的风险较高的人，这最终可能有助于临床医生更快地诊断患者。”

研究小组还发现 DIP2B 基因中的 TRE 与患心肌病的较高风险之间存在相关性。 揭示 TRE 的确切位置有助于开发精准疗法，作为精准儿童健康 (Precision Child Health) 的一部分，这是 SickKids 的一项运动，旨在为每位患者提供个性化护理。

我们对某种疾病的遗传学了解得越多，我们的治疗就越精确，从而为心肌病和许多其他具有遗传因素的疾病患者提供护理。”

Seema Mital 博士，遗传学和基因组生物学项目的高级科学家、心脏病科的心脏病专家以及 SickKids 的心血管研究负责人

TRE 为心肌病干预提供了新目标

研究小组检查了 1,200 名心肌病患者的基因组。 与没有心脏病史的研究参与者相比，Yuen 的研究小组发现，在人体内很少扩展的串联重复序列在患有心肌病的个体中更多地存在。 研究人员注意到主要影响心脏的基因中的串联重复，特别是在左心室中，左心室负责将含氧血液泵入体内。

研究小组还注意到，父母患有心肌病的孩子有更大的 TRE，这种现象被称为“遗传预期”。 当 TRE 变大时，基因功能被破坏的可能性就更高。 较大的 TRE 还会导致更早发病和更严重的症状，这就是为什么科学家正在研究如何减缓其生长。

“我们的最终目标是看看是否有办法阻止或扭转这些扩张，以改善患者的治疗效果，”袁说。 “通过了解 TRE 背后的机制，我们可以帮助减少其遗传影响。”

Yuen 实验室和 SickKids 应用基因组学中心 (TCAG) 开发的新型计算方法使团队能够全面检查基因组序列数据，以准确定位 TRE 在人基因组中的位置和大小。

“通过全基因组测序，我们可以观察整个基因组中的 TRE，以帮助更全面地了解一个人的遗传倾向，”Yuen 实验室的博士后研究员、该研究的第一作者 Aleksandra (Sasha) Mitina 博士说。

利用这项技术，袁未来的研究将应用类似的方法来研究基因组区域，这可以帮助科学家开发针对心肌病以外疾病的治疗方法。

这项研究由安大略省政府、加拿大健康研究院 (CIHR)、Azrieli 基金会、多伦多大学麦克劳林中心、泰德·罗杰斯心脏研究中心、多伦多大学数据科学研究所资助，安大略省心脏和中风基金会、Bitove 基金会、加拿大创新基金会、加拿大基因组和 SickKids Catalyst 遗传学学者。

研究小组感谢所有参与心脏中心生物银行登记的家庭，他们帮助使这项研究成为可能。

来源：

病童医院

期刊参考：

米蒂纳，A.， 等人。 (2024) 全基因组增强子相关串联重复序列在心肌病中得到扩展。 电子生物医学。 doi.org/10.1016/j.ebiom.2024.105027。

2024-02-28 03:49:00
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