通过家庭蛋白质组学分析在干血斑中检测到 COVID-19 感染

自 COVID-19 出现以来的这些年里,科学家们已经了解了很多关于这种感染是如何发生的以及它对身体各个系统的一些长期影响的知识。 迄今为止,许多研究都集中在该疾病严重病例的影响上。 不太清楚的是感染对症状轻微或无症状的人的长期生理影响。 来自瑞典皇家理工学院和瑞典其他机构的科学家旨在通过分析使用家庭试剂盒收集的普通人群干血样本中的抗体来阐明这个问题。

在 Communications Medici 发表的一篇新论文中这是 标题为“家庭采样的干血斑的蛋白质组分析揭示了 SARS-CoV-2 感染的蛋白质,”作者解释了他们如何使用家庭采样的干血斑 (DBS) 的深度蛋白质组分析来评估 SARS-CoV-2 对瑞典城市地区轻度症状或无症状个体的影响。 研究人员写道:“在临床血浆和血清样本中,深入的蛋白质组学分析已经为了解 COVID-19 的病理学和发病机制提供了宝贵的见解。” “我们的 DBS 研究旨在证明自我采样的实用性,并通过考虑血清学表型来识别与 SARS-CoV-2 感染相关的循环蛋白。”

虽然这项研究的重点是 COVID-19,但转化蛋白质组学教授、HUPO 人类血浆蛋白质组项目主席、该论文的资深作者 Jochen Schwenk 博士指出,该方法可以适用于需要大量人群研究的其他情况。评估与疾病发展和治疗反应有关的各种遗传、表型和环境因素。

Jochen Schwenk 博士,KTH 皇家理工学院转化蛋白质组学教授,HUPO 人类血浆蛋白质组项目主席,该研究的资深作者 [Gustav Ceder]在这项研究中,该团队向瑞典两个主要城市的人们运送了数千个试剂盒,使他们能够在家中收集样本。 具体来说,他们于 2020 年春季向斯德哥尔摩的 2,000 个随机家庭发送了试剂盒。在 COVID-19 疫苗问世后,该团队于 2021 年夏季向斯德哥尔摩和哥德堡的随机家庭发送了另外 2,000 个试剂盒,使他们能够了解更多信息免疫反应和疫苗的效果。

该套件由瑞典医疗科技公司 Capitainer 开发。 该公司用于这项研究的 qDBS 系统具有安装在卡上的毛细管系统,用于从手指刺破处采集血液。 它包括一个智能芯片,可确保患者捕获精确体积的血液(10 微升),以及一个彩色指示器,让他们知道他们的样本已成功捕获。 套件还附带安全、无菌采集血液样本的说明。 相同的套件被用于 哈佛大学的 VIVID 研究旨在确定补充维生素 D 对 COVID-19 疾病进展和暴露后预防的影响。

Capitainer 开发的样本采集系统用于从目标人群中采集血液样本。 [Gustav Ceder]获得样本后,患者将带有血液样本的卡片寄回给研究人员进行分析。 一个问题是是否有足够多的人将试剂盒送回实验室进行分析。 然而,施文克说,民众的反应非常积极,超过一半的家庭寄回了带有血样的卡片(约 1,100 个试剂盒)并填写了调查问卷。 他补充说,返回样本的人总体上代表了斯德哥尔摩的人口,尽管年轻人在该群体中的代表性似乎不足。

根据该论文,科学家们对他们收到的一部分样本进行了三项研究,并根据患者的血清状况和自我报告的信息将患者分配到研究中。 他们写道:“我们比较了血清反应呈阳性和血清反应呈阴性的受试者(研究 1)以及被分类为第一波大流行的早期或感染后阶段的捐赠者(研究 2)。” “我们还研究了第三波大流行中未接种疫苗的血清阳性和血清阴性受试者(研究 3)。”

前两项研究的参与者来自 2020 年春季发出的第一轮测试,而第三项研究的参与者来自第二批测试。 该团队总共查看了 228 人的数据进行研究。

他们使用 Olink Proteomics 开发的邻近延伸测定法测试了样本中 250 多种与心血管疾病和代谢相关的血液蛋白。 结果显示,在大流行初期从血清阳性和血清阴性人群中收集的血液样本显示出与免疫、炎症、凝血和应激反应有关的各种蛋白质。 数据还显示,大流行后期收集的血液样本中 B 细胞上的病毒受体水平不同。

Schwenk 和他的团队将应用从这项初步研究中吸取的经验教训,包括他们在未来的研究中处理样本和数据时所采用的一些最佳实践。 他们还对在其他疾病领域开展此类研究的可行性持乐观态度。 例如,类似的方法可用于收集季节性过敏患者在接受特定干预或治疗前后的数据,或评估炎症蛋白对过敏原的反应变化,他说。

此外,由于与传统的血液检测相比,这种检测的基础设施要求相对较低,因此这样的方法也可以应用于研究资源有限地区或难以到达的地理位置的人群的疾病。

2024-04-03 00:46:51
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